作為島津LCMS-8060/8050糖鏈定性、定量分析MRM方法制作軟件平臺(tái),島津EreximTM分析應(yīng)用軟件套裝即日起在中國上市。
EreximTM是 Energy-resolved oxionium ion monitoring英文中下劃線部分拼寫出來的詞語。當(dāng)使用串聯(lián)質(zhì)譜分析N-糖鏈和糖肽這類主體結(jié)構(gòu)為N-糖鏈時(shí),產(chǎn)物離子(氧鎓離子)會(huì)隨著糖鏈結(jié)構(gòu)的變化而不同。尤其是在三重四極串聯(lián)質(zhì)譜MRM分析方式下分析每種產(chǎn)物離子的時(shí)候,每個(gè)氧鎓離子的信號(hào)強(qiáng)度也隨著碰撞能(以下用字母CE表述)的改變而不同。當(dāng)繪制了每個(gè)氧鎓離子在不同CE值下的信號(hào)強(qiáng)度趨勢(shì)曲線后,你可以憑借其*的CE配置文件譜圖來表征氧鎓離子的結(jié)構(gòu)。并排比較這些CE配置文件譜圖,就可以預(yù)測(cè)糖鏈間的結(jié)構(gòu)差異。糖鏈中zui典型的氧鎓離子是從N-糖鏈核心結(jié)構(gòu)中得到的(m/z 138)特異性離子。對(duì)N-糖鏈核心結(jié)構(gòu)及糖鏈的存在比例的分析可實(shí)現(xiàn)糖鏈間相對(duì)含量的測(cè)定。EreximTM突破性的技術(shù)可在沒有準(zhǔn)備標(biāo)品的情況下測(cè)算每種糖鏈的結(jié)構(gòu)和糖鏈間的相對(duì)含量,EreximTM分析應(yīng)用軟件套裝是島津基礎(chǔ)技術(shù)實(shí)驗(yàn)室和日本理化學(xué)研究所合作開發(fā)的技術(shù)。
糖鏈在生理學(xué)領(lǐng)域扮演重要角色。在藥物研發(fā)和生物制藥領(lǐng)域中需要檢檢測(cè)化學(xué)結(jié)構(gòu)、相對(duì)比例及糖鏈與蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)等信息。但由于糖鏈檢測(cè)的復(fù)雜性、異質(zhì)性,很難得到相關(guān)信息,需要新技術(shù)和專門的軟件來實(shí)現(xiàn)以上檢測(cè)。同時(shí),本專業(yè)軟件可實(shí)現(xiàn)生物制藥領(lǐng)域研究工作的流程化。分析N-糖鏈經(jīng)常首先需要從蛋白質(zhì)上解離糖鏈。盡管這種方法可實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的定量和定性,得到的結(jié)果可給出了一個(gè)大致的糖鏈的糖蛋白,糖基化位點(diǎn)的分布圖。為了更好的觀注特定的糖基化位點(diǎn)導(dǎo)致的多糖異質(zhì)性等信息,需要在糖鏈經(jīng)過蛋白質(zhì)的酶水解后使用儀器分析。而EreximTM分析應(yīng)用軟件套裝是便于分析原型糖鏈的更好的解決方案。
EreximTM應(yīng)用軟件套裝構(gòu)成:
I.MRM方法編輯器, II.數(shù)據(jù)分析器, III. 配置文件數(shù)據(jù)庫管理器
以上3個(gè)程序組件可用于簡(jiǎn)化方法的生成:(I)自動(dòng)轉(zhuǎn)化分析結(jié)果至譜圖;(II)實(shí)現(xiàn)注冊(cè)和編輯基礎(chǔ)信息,包括化學(xué)結(jié)構(gòu)信息。使用以上3種軟件工具可直觀的轉(zhuǎn)化糖鏈結(jié)構(gòu)中生成的所有產(chǎn)物離子信息以便設(shè)定MRM檢測(cè)條件。
另外, 憑借串聯(lián)質(zhì)譜采集MRM數(shù)據(jù)流,可生成糖鏈存在比例譜圖。以便直觀了解糖鏈的異質(zhì)性。自動(dòng)生成的EreximTM配置文件可實(shí)現(xiàn)糖鏈的結(jié)構(gòu)鑒定。糖鏈和糖肽MRM方法編輯器與MRM方法編輯器相似,整合在上述的EreximTM應(yīng)用軟件套裝中。糖鏈和糖肽MRM方法編輯器可以單獨(dú)銷售。糖鏈和糖肽MRM方法編輯器幫助我們創(chuàng)建方法,獲取存在于蛋白質(zhì)上的N-糖鏈的定性和定量信息。同時(shí)幫助提高糖鏈研究成果效率和加快生化制藥領(lǐng)域研究進(jìn)展。